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科技服務 MeDIP甲基化測序
表觀遺傳學研究服務-MeDIP甲基化測序
MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing)測序是基于抗體富集原理進行測序的全基因組甲基化檢測技術,采用甲基化DNA免疫共沉淀技術,通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發生甲基化的DNA片段,然后通過高通量測序可以在全基因組水平上進行高精度的CpG密集的高甲基化區域研究。
    
hMeDIP-Seq(hydroxymethylcytosine DNA Immunoprecipitation Sequencing)測序基于原理同MeDIP-Seq。利用5'-羥甲基胞嘧啶(5hmC)抗體特異性富集基因組上發生甲基化的DNA片段。5hmC是新發現的一種的修飾堿基,由10-11易位(TET)家族的酶通過氧化5mC產生的。5hmC不僅能夠降低MeCP蛋白的甲基化結合結構域(MBD) 與甲基化DNA的親和性,具有潛在的參與基因表達調控的轉錄調節功能,而且參與了DNA去甲基化過程。
 
研究人員可以利用MeDIP-Seq和hMeDIP-Seq技術快速有效地尋找基因組上的甲基化區域,從而比較不同細胞、組織或疾病樣本間的DNA甲基化修飾模式的差異,為生物學研究或臨床應用方案提供理論證據。
 
 
技術優勢
 
1 全轉錄組范圍研究mRNA的甲基化位點
2 通過抗體富集的方法,充分利用了抗體的靈敏性
3 分析方法類似ChIP-seq,數據分析相對成熟
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