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科技服務 鏈特異性轉錄組測序
轉錄組層次研究服務-鏈特異性轉錄組測序

6场半全场中几场才有奖 www.ymuqym.com.cn 鏈特異性轉錄組測序(strand-specific RNA sequencing)是指在構建測序文庫時,利用Illumina高保真Taq酶將mRNA鏈的方向信息保存到測序文庫中。測序后的數據分析可確定轉錄本是來自正義還是反義DNA鏈。與普通轉錄組測序相比,它更能準確地統計轉錄本的數量和確定基因的結構,同時可以發現更多的反義轉錄本,目前被廣泛地應用于研究基因結構和基因表達調控等領域范圍。

 

應用方向 

 

1) 模式生物基因結構分析:

模式生物已經有完整的基因注釋信息,但是實際研究中存在個體差異性。利用鏈特異性轉錄組測序可以對個體表達基因的結構進行深度分析,對基因進行重注釋。

2) 差異基因準確分析:
能針對不同轉錄方向的基因進行精確的表達量統計及差異表達分析,從而推斷出與功能狀態變化相關聯的候選基因,揭示差異基因的功能分類和相關代謝通路。

3) 原核生物操縱子分析:

對原核生物的鏈特異性轉錄組分析,能更加準確地進行操縱子鑒定和分析。

 

技術優勢:

 

1) 精確度高:文庫制備和測序過程中保留了RNA方向信息,有效數據增多,從而使基因表達定量更加準確。與基因組和參考基因組的比對結果,其鏈特異的結果均相近或稍高于非特異性結果。
2) 豐富度高:準確發現反義轉錄本,獲取更多轉錄本相關信息,進行鑒定分析。

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